Les Comptes Eau concernent les stocks physiques (réserves et zones humides) et monétaires (coût de l’approvisionnement en eau pour chaque secteur, les tarifs de consommation et d’utilisation de l’eau, les subventions aux associations des usagers). A ce jour, l’agriculture irriguée est le plus grand secteur utilisateur d’eau dans tout Madagascar. Aussi, des études ont été menées pour évaluer la valeur ajoutée par m3 d’eau dans le secteur agricole irrigué des bassins du Lac Alaotra et de Marovoay.